Atlantis II präsentiert sich, wie auch schon sein Vorgänger, in der Tradition des grafisch anspruchsvollen Fantasy-Adventures. Das Spiel mischt auf eigenwillige Art mythische und esoterische Elemente mit der exotischen Kultur anderer Länder. So findet der Spieler tibetanische Kulturfragmente genauso wieder, wie die von antiurbaner Weltanschauung getragenen christlichen Einflüsse Irlands.

Um die hochauflösende, bis ins kleinste Detail ausgearbeitete Spielwelt realisieren zu können, griff Cryo auf die hauseigene modifizierte OmniSync-3-D-Engine zurück. Die Game-Engine ermöglicht es nacheinander verschiedene Haltepunkte anzusteuern - die Bewegung erfolgt durch vorberechnete Kamerafahrten - und dort mit einem Rundumblick die Umgebung zu betrachten und zu untersuchen. Die gebotene Grafik ist von melancholischer Poesie und wird von einem ethnischen Soundteppich getragen, der schon für sich allein das Hinhören lohnt.

Zu Beginn der Handlung ist der Spieler über seine eigentlichen Ziele nur sehr unzureichend informiert. In der Rolle des jungen Tibetaners Than und als auserwählter Träger des Lichts, erhält man die mysteriöse Aufgabe, das Gleichgewicht von Gut und Böse wiederherzustellen. Zu diesem Zweck kann man fünf unterschiedliche Welten bereisen und ein Puzzlestück nach dem anderen zusammentragen, um die Welt von Atlantis II vor dem Sturz ins Chaos zu bewahren. Der Spieler muß sich jedoch die Zusammenhänge bisweilen schwer erarbeiten, so daß sich das Eintauchen in die Geschichte von Atlantis II als echt zeitraubende und zähe Angelegenheit entpuppt. Für den Spieler jedoch, welcher entsprechende Ausdauer beweist, eröffnet sich ein phantastisches Universum, mit vielen kulturellen Anspielungen und einer komplexen relativ offenen Hintergrundgeschichte.